showing outputs in notebook
This commit is contained in:
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" createBatchCodeTable(createDataFrame(\"VAERS\", manufacturer)).to_excel(excelFile)\n"
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" batchCodeTable = createBatchCodeTable(createDataFrame(\"VAERS\", manufacturer))\n",
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"'MODERNA'"
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|
||||||
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|
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|
||||||
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" .dataframe tbody tr th {\n",
|
||||||
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|
||||||
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|
||||||
|
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|
||||||
|
" .dataframe thead th {\n",
|
||||||
|
" text-align: right;\n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
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|
||||||
|
"<table border=\"1\" class=\"dataframe\">\n",
|
||||||
|
" <thead>\n",
|
||||||
|
" <tr style=\"text-align: right;\">\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th>ADRs</th>\n",
|
||||||
|
" <th>DEATHS</th>\n",
|
||||||
|
" <th>DISABILITIES</th>\n",
|
||||||
|
" <th>LIFE THREATENING ILLNESSES</th>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>VAX_LOT</th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" </thead>\n",
|
||||||
|
" <tbody>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>026L20A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>4177</td>\n",
|
||||||
|
" <td>42.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>35.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>28.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>039K20A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>4169</td>\n",
|
||||||
|
" <td>93.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>39.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>37.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>011J20A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>3661</td>\n",
|
||||||
|
" <td>37.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>33.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>28.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>013L20A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>3191</td>\n",
|
||||||
|
" <td>68.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>47.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>32.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>012L20A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>3068</td>\n",
|
||||||
|
" <td>72.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>30.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>30.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>...</th>\n",
|
||||||
|
" <td>...</td>\n",
|
||||||
|
" <td>...</td>\n",
|
||||||
|
" <td>...</td>\n",
|
||||||
|
" <td>...</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>029L2VA</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>029L2oa</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>029L30A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>029L420A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>Ø38B21A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" </tbody>\n",
|
||||||
|
"</table>\n",
|
||||||
|
"<p>16284 rows × 4 columns</p>\n",
|
||||||
|
"</div>"
|
||||||
|
],
|
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"text/plain": [
|
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|
" ADRs DEATHS DISABILITIES LIFE THREATENING ILLNESSES\n",
|
||||||
|
"VAX_LOT \n",
|
||||||
|
"026L20A 4177 42.0 35.0 28.0\n",
|
||||||
|
"039K20A 4169 93.0 39.0 37.0\n",
|
||||||
|
"011J20A 3661 37.0 33.0 28.0\n",
|
||||||
|
"013L20A 3191 68.0 47.0 32.0\n",
|
||||||
|
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|
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|
"... ... ... ... ...\n",
|
||||||
|
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|
||||||
|
"029L2oa 1 0.0 0.0 0.0\n",
|
||||||
|
"029L30A 1 0.0 0.0 0.0\n",
|
||||||
|
"029L420A 1 0.0 0.0 0.0\n",
|
||||||
|
"Ø38B21A 1 0.0 0.0 0.0\n",
|
||||||
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|
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"[16284 rows x 4 columns]"
|
||||||
|
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|
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||||||
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"/home/frankknoll/.local/lib/python3.9/site-packages/pandas/compat/_optional.py:149: UserWarning: Pandas requires version '1.2.2' or newer of 'xlsxwriter' (version '1.1.2' currently installed).\n",
|
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|
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|
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|
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|
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|
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"text/plain": [
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"'PFIZER\\\\BIONTECH'"
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|
||||||
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" vertical-align: middle;\n",
|
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" }\n",
|
||||||
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|
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" .dataframe tbody tr th {\n",
|
||||||
|
" vertical-align: top;\n",
|
||||||
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" }\n",
|
||||||
|
"\n",
|
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" .dataframe thead th {\n",
|
||||||
|
" text-align: right;\n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
|
"</style>\n",
|
||||||
|
"<table border=\"1\" class=\"dataframe\">\n",
|
||||||
|
" <thead>\n",
|
||||||
|
" <tr style=\"text-align: right;\">\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th>ADRs</th>\n",
|
||||||
|
" <th>DEATHS</th>\n",
|
||||||
|
" <th>DISABILITIES</th>\n",
|
||||||
|
" <th>LIFE THREATENING ILLNESSES</th>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>VAX_LOT</th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" </thead>\n",
|
||||||
|
" <tbody>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>EK9231</th>\n",
|
||||||
|
" <td>3392</td>\n",
|
||||||
|
" <td>48.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>56.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>35.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>ER2613</th>\n",
|
||||||
|
" <td>3345</td>\n",
|
||||||
|
" <td>65.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>62.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>57.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>EN6201</th>\n",
|
||||||
|
" <td>2928</td>\n",
|
||||||
|
" <td>148.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>69.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>55.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>EN5318</th>\n",
|
||||||
|
" <td>2811</td>\n",
|
||||||
|
" <td>114.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>62.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>57.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>ER8732</th>\n",
|
||||||
|
" <td>2705</td>\n",
|
||||||
|
" <td>50.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>51.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>68.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>...</th>\n",
|
||||||
|
" <td>...</td>\n",
|
||||||
|
" <td>...</td>\n",
|
||||||
|
" <td>...</td>\n",
|
||||||
|
" <td>...</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>EN6203 UPC</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>EN6203,</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>EN6203, EL3247</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>EN6203, EN6204</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>ÉÑ6198</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" </tbody>\n",
|
||||||
|
"</table>\n",
|
||||||
|
"<p>12447 rows × 4 columns</p>\n",
|
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|
"</div>"
|
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|
],
|
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|
" ADRs DEATHS DISABILITIES LIFE THREATENING ILLNESSES\n",
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|
"VAX_LOT \n",
|
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|
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|
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|
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"EN6201 2928 148.0 69.0 55.0\n",
|
||||||
|
"EN5318 2811 114.0 62.0 57.0\n",
|
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"ER8732 2705 50.0 51.0 68.0\n",
|
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|
"... ... ... ... ...\n",
|
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"EN6203 UPC 1 0.0 0.0 0.0\n",
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"EN6203, EN6204 1 0.0 0.0 0.0\n",
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"[12447 rows x 4 columns]"
|
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|
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"/home/frankknoll/.local/lib/python3.9/site-packages/pandas/compat/_optional.py:149: UserWarning: Pandas requires version '1.2.2' or newer of 'xlsxwriter' (version '1.1.2' currently installed).\n",
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"'JANSSEN'"
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"text/html": [
|
||||||
|
"<div>\n",
|
||||||
|
"<style scoped>\n",
|
||||||
|
" .dataframe tbody tr th:only-of-type {\n",
|
||||||
|
" vertical-align: middle;\n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
" .dataframe tbody tr th {\n",
|
||||||
|
" vertical-align: top;\n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
" .dataframe thead th {\n",
|
||||||
|
" text-align: right;\n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
|
"</style>\n",
|
||||||
|
"<table border=\"1\" class=\"dataframe\">\n",
|
||||||
|
" <thead>\n",
|
||||||
|
" <tr style=\"text-align: right;\">\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th>ADRs</th>\n",
|
||||||
|
" <th>DEATHS</th>\n",
|
||||||
|
" <th>DISABILITIES</th>\n",
|
||||||
|
" <th>LIFE THREATENING ILLNESSES</th>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>VAX_LOT</th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" </thead>\n",
|
||||||
|
" <tbody>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>Unknown</th>\n",
|
||||||
|
" <td>7312</td>\n",
|
||||||
|
" <td>264.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>19.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>31.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>043A21A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>2347</td>\n",
|
||||||
|
" <td>37.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>31.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>49.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>042A21A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>2170</td>\n",
|
||||||
|
" <td>44.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>41.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>43.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>1805018</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1756</td>\n",
|
||||||
|
" <td>35.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>36.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>49.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>202A21A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1726</td>\n",
|
||||||
|
" <td>25.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>21.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>25.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>...</th>\n",
|
||||||
|
" <td>...</td>\n",
|
||||||
|
" <td>...</td>\n",
|
||||||
|
" <td>...</td>\n",
|
||||||
|
" <td>...</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>180E018</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>180D068</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>180C068</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>180B982</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>zz</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" </tbody>\n",
|
||||||
|
"</table>\n",
|
||||||
|
"<p>2456 rows × 4 columns</p>\n",
|
||||||
|
"</div>"
|
||||||
|
],
|
||||||
|
"text/plain": [
|
||||||
|
" ADRs DEATHS DISABILITIES LIFE THREATENING ILLNESSES\n",
|
||||||
|
"VAX_LOT \n",
|
||||||
|
"Unknown 7312 264.0 19.0 31.0\n",
|
||||||
|
"043A21A 2347 37.0 31.0 49.0\n",
|
||||||
|
"042A21A 2170 44.0 41.0 43.0\n",
|
||||||
|
"1805018 1756 35.0 36.0 49.0\n",
|
||||||
|
"202A21A 1726 25.0 21.0 25.0\n",
|
||||||
|
"... ... ... ... ...\n",
|
||||||
|
"180E018 1 0.0 0.0 0.0\n",
|
||||||
|
"180D068 1 0.0 0.0 0.0\n",
|
||||||
|
"180C068 1 0.0 0.0 0.0\n",
|
||||||
|
"180B982 1 0.0 0.0 0.0\n",
|
||||||
|
"zz 1 0.0 0.0 0.0\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"[2456 rows x 4 columns]"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"metadata": {},
|
||||||
|
"output_type": "display_data"
|
||||||
|
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|
||||||
|
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|
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|
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|
||||||
|
"output_type": "stream",
|
||||||
|
"text": [
|
||||||
|
"/home/frankknoll/.local/lib/python3.9/site-packages/pandas/compat/_optional.py:149: UserWarning: Pandas requires version '1.2.2' or newer of 'xlsxwriter' (version '1.1.2' currently installed).\n",
|
||||||
|
" warnings.warn(msg, UserWarning)\n"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
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|
||||||
|
],
|
||||||
"source": [
|
"source": [
|
||||||
"saveBatchCodeTable(\"MODERNA\", \"results/moderna.xlsx\")\n",
|
"saveBatchCodeTable(\"MODERNA\", \"results/moderna.xlsx\")\n",
|
||||||
"saveBatchCodeTable(\"PFIZER\\BIONTECH\", \"results/pfizer.xlsx\")\n",
|
"saveBatchCodeTable(\"PFIZER\\BIONTECH\", \"results/pfizer.xlsx\")\n",
|
||||||
@@ -82,7 +550,7 @@
|
|||||||
},
|
},
|
||||||
{
|
{
|
||||||
"cell_type": "code",
|
"cell_type": "code",
|
||||||
"execution_count": null,
|
"execution_count": 14,
|
||||||
"id": "9f506ac8",
|
"id": "9f506ac8",
|
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|
"metadata": {},
|
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"outputs": [],
|
||||||
@@ -92,7 +560,7 @@
|
|||||||
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|
},
|
||||||
{
|
{
|
||||||
"cell_type": "code",
|
"cell_type": "code",
|
||||||
"execution_count": null,
|
"execution_count": 15,
|
||||||
"id": "e14465d7",
|
"id": "e14465d7",
|
||||||
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|
"metadata": {},
|
||||||
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|
"outputs": [],
|
||||||
@@ -126,10 +594,274 @@
|
|||||||
},
|
},
|
||||||
{
|
{
|
||||||
"cell_type": "code",
|
"cell_type": "code",
|
||||||
"execution_count": null,
|
"execution_count": 16,
|
||||||
"id": "ef8f99c4",
|
"id": "ef8f99c4",
|
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"metadata": {},
|
"metadata": {},
|
||||||
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|
"outputs": [
|
||||||
|
{
|
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|
||||||
|
"output_type": "stream",
|
||||||
|
"text": [
|
||||||
|
"test_createBatchCodeTable (__main__.HowBadIsMyBatchTest) ... "
|
||||||
|
]
|
||||||
|
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|
||||||
|
{
|
||||||
|
"data": {
|
||||||
|
"text/plain": [
|
||||||
|
"'dataFrame:'"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
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|
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|
||||||
|
"output_type": "display_data"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
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|
||||||
|
"text/html": [
|
||||||
|
"<div>\n",
|
||||||
|
"<style scoped>\n",
|
||||||
|
" .dataframe tbody tr th:only-of-type {\n",
|
||||||
|
" vertical-align: middle;\n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
" .dataframe tbody tr th {\n",
|
||||||
|
" vertical-align: top;\n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
" .dataframe thead th {\n",
|
||||||
|
" text-align: right;\n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
|
"</style>\n",
|
||||||
|
"<table border=\"1\" class=\"dataframe\">\n",
|
||||||
|
" <thead>\n",
|
||||||
|
" <tr style=\"text-align: right;\">\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th>DIED</th>\n",
|
||||||
|
" <th>L_THREAT</th>\n",
|
||||||
|
" <th>DISABLE</th>\n",
|
||||||
|
" <th>VAX_TYPE</th>\n",
|
||||||
|
" <th>VAX_MANU</th>\n",
|
||||||
|
" <th>VAX_LOT</th>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>VAERS_ID</th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" </thead>\n",
|
||||||
|
" <tbody>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>916600</th>\n",
|
||||||
|
" <td>Y</td>\n",
|
||||||
|
" <td>NaN</td>\n",
|
||||||
|
" <td>NaN</td>\n",
|
||||||
|
" <td>COVID19</td>\n",
|
||||||
|
" <td>MODERNA</td>\n",
|
||||||
|
" <td>037K20A</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>916601</th>\n",
|
||||||
|
" <td>NaN</td>\n",
|
||||||
|
" <td>NaN</td>\n",
|
||||||
|
" <td>Y</td>\n",
|
||||||
|
" <td>COVID19</td>\n",
|
||||||
|
" <td>MODERNA</td>\n",
|
||||||
|
" <td>025L20A</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>1996874</th>\n",
|
||||||
|
" <td>NaN</td>\n",
|
||||||
|
" <td>NaN</td>\n",
|
||||||
|
" <td>Y</td>\n",
|
||||||
|
" <td>COVID19</td>\n",
|
||||||
|
" <td>MODERNA</td>\n",
|
||||||
|
" <td>025L20A</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" </tbody>\n",
|
||||||
|
"</table>\n",
|
||||||
|
"</div>"
|
||||||
|
],
|
||||||
|
"text/plain": [
|
||||||
|
" DIED L_THREAT DISABLE VAX_TYPE VAX_MANU VAX_LOT\n",
|
||||||
|
"VAERS_ID \n",
|
||||||
|
"916600 Y NaN NaN COVID19 MODERNA 037K20A\n",
|
||||||
|
"916601 NaN NaN Y COVID19 MODERNA 025L20A\n",
|
||||||
|
"1996874 NaN NaN Y COVID19 MODERNA 025L20A"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
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|
||||||
|
"output_type": "display_data"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
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|
||||||
|
"text/plain": [
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||||||
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"'batchCodeTable:'"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
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|
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|
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|
"output_type": "display_data"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"data": {
|
||||||
|
"text/html": [
|
||||||
|
"<div>\n",
|
||||||
|
"<style scoped>\n",
|
||||||
|
" .dataframe tbody tr th:only-of-type {\n",
|
||||||
|
" vertical-align: middle;\n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
" .dataframe tbody tr th {\n",
|
||||||
|
" vertical-align: top;\n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
" .dataframe thead th {\n",
|
||||||
|
" text-align: right;\n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
|
"</style>\n",
|
||||||
|
"<table border=\"1\" class=\"dataframe\">\n",
|
||||||
|
" <thead>\n",
|
||||||
|
" <tr style=\"text-align: right;\">\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th>ADRs</th>\n",
|
||||||
|
" <th>DEATHS</th>\n",
|
||||||
|
" <th>DISABILITIES</th>\n",
|
||||||
|
" <th>LIFE THREATENING ILLNESSES</th>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>VAX_LOT</th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" </thead>\n",
|
||||||
|
" <tbody>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>025L20A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>2</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>2.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>037K20A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>1.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0.0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" </tbody>\n",
|
||||||
|
"</table>\n",
|
||||||
|
"</div>"
|
||||||
|
],
|
||||||
|
"text/plain": [
|
||||||
|
" ADRs DEATHS DISABILITIES LIFE THREATENING ILLNESSES\n",
|
||||||
|
"VAX_LOT \n",
|
||||||
|
"025L20A 2 0.0 2.0 0.0\n",
|
||||||
|
"037K20A 1 1.0 0.0 0.0"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"metadata": {},
|
||||||
|
"output_type": "display_data"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"data": {
|
||||||
|
"text/plain": [
|
||||||
|
"'batchCodeTableExpected:'"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"metadata": {},
|
||||||
|
"output_type": "display_data"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"data": {
|
||||||
|
"text/html": [
|
||||||
|
"<div>\n",
|
||||||
|
"<style scoped>\n",
|
||||||
|
" .dataframe tbody tr th:only-of-type {\n",
|
||||||
|
" vertical-align: middle;\n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
" .dataframe tbody tr th {\n",
|
||||||
|
" vertical-align: top;\n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
" .dataframe thead th {\n",
|
||||||
|
" text-align: right;\n",
|
||||||
|
" }\n",
|
||||||
|
"</style>\n",
|
||||||
|
"<table border=\"1\" class=\"dataframe\">\n",
|
||||||
|
" <thead>\n",
|
||||||
|
" <tr style=\"text-align: right;\">\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th>ADRs</th>\n",
|
||||||
|
" <th>DEATHS</th>\n",
|
||||||
|
" <th>DISABILITIES</th>\n",
|
||||||
|
" <th>LIFE THREATENING ILLNESSES</th>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>VAX_LOT</th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" <th></th>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" </thead>\n",
|
||||||
|
" <tbody>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>025L20A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>2</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>2</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" <tr>\n",
|
||||||
|
" <th>037K20A</th>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>1</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0</td>\n",
|
||||||
|
" <td>0</td>\n",
|
||||||
|
" </tr>\n",
|
||||||
|
" </tbody>\n",
|
||||||
|
"</table>\n",
|
||||||
|
"</div>"
|
||||||
|
],
|
||||||
|
"text/plain": [
|
||||||
|
" ADRs DEATHS DISABILITIES LIFE THREATENING ILLNESSES\n",
|
||||||
|
"VAX_LOT \n",
|
||||||
|
"025L20A 2 0 2 0\n",
|
||||||
|
"037K20A 1 1 0 0"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"metadata": {},
|
||||||
|
"output_type": "display_data"
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"name": "stderr",
|
||||||
|
"output_type": "stream",
|
||||||
|
"text": [
|
||||||
|
"ok\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"----------------------------------------------------------------------\n",
|
||||||
|
"Ran 1 test in 0.180s\n",
|
||||||
|
"\n",
|
||||||
|
"OK\n"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
{
|
||||||
|
"data": {
|
||||||
|
"text/plain": [
|
||||||
|
"<unittest.main.TestProgram at 0x7fb670669c10>"
|
||||||
|
]
|
||||||
|
},
|
||||||
|
"execution_count": 16,
|
||||||
|
"metadata": {},
|
||||||
|
"output_type": "execute_result"
|
||||||
|
}
|
||||||
|
],
|
||||||
"source": [
|
"source": [
|
||||||
"unittest.main(argv = [''], verbosity = 2, exit = False)"
|
"unittest.main(argv = [''], verbosity = 2, exit = False)"
|
||||||
]
|
]
|
||||||
|
|||||||
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